В данном произведении группа друзей, включая Конана, профессора Агасу, Ран, Хайбару и Детективов, оказывается на открытии смотровой площадки высоко расположенной башни. Их радостное времяпрепровождение прерывается, когда в окно влетает пуля, раня мужчину и вызывая панику среди присутствующих. Конан, проявляя хладнокровие, использует свои специальные очки, чтобы отследить путь пули и обнаружить снайпера. Вместе с Масуми Сера, которая также была на месте происшествия, они отправляются в погоню на мотоцикле, но ситуация быстро выходит из-под контроля, когда преступник начинает стрелять и использует гранаты, чтобы остановить преследователей. В погоню вовлекаются даже агенты ФБР, однако снайпер и его тайны исчезают в океане.

Расследование вскоре выявляет связь с элитным подразделением ВМС США и другими бывшими военными, работающими в Японии. Однако первое нападение — это лишь начало, и с каждым новым выстрелом паника охватывает жителей Токио. Конан сталкивается с загадками, оставленными снайпером, и оказывается под прицелом, но Масуми вовремя вмешивается, спасая его ценой собственного здоровья. В это время на сцену выходит Subaru Okiya, который начинает действовать по своим планам.

Снайпером оказывается Кевин Ёсина, а весь замысел убийств был разработан его наставником Тимоти Хантером. Кевин, став учеником Хантера, решает помочь ему в осуществлении плана, чтобы отдать должное за спасение своей жизни во время военных операций. Мотивом серийных убийств становится зависть Уолта к достижениям Хантера, что приводит к сложной игре интриг и предательств.

Кевин пытается расправиться с Уолтом, но Конан вмешивается, чтобы спасти его. В то время как Ран, не зная о планах Конана, решает сама остановить Кевина, она оказывается в опасности, но благодаря совместным усилиям друзей ей удается справиться с угрозой. В финале Subaru получает звонок, который открывает новые горизонты для дальнейшего развития событий.