Легавый 2 переносит зрителей в лето 1952 года, спустя три года после событий первого сезона. В это время в работе главного героя, Козырева, произошли значительные изменения. В Петропавловском управлении внутренних дел была создана специальная группа по борьбе с преступностью, и Козырев назначен её руководителем. Преступный мир также претерпел изменения: на место Чалого, который был убран, приходит новый 'куратор' по имени Гангрена. В отличие от своего предшественника, он отличается жадностью, безжалостностью и жестокостью.

Неожиданно из ГУЛАГа освобождается Павливкер, который, будучи оправданным, возвращается на службу и получает повышение в Министерстве государственной безопасности. Однако его возвращение не приносит спокойствия, и вскоре Козырев оказывается в тюрьме, став жертвой хитроумной ловушки, подготовленной Павливкером. В это время Чалый, действуя в своих интересах, предает Гангрену и устраняет его с поста куратора.

С помощью Чалого Козырев, а также его коллеги Баженина и детектива Грунина из Московского уголовного розыска, начинают распутывать сложную паутину интриг и преступлений, организованных Павливкером. Сюжет насыщен напряжёнными моментами, неожиданными поворотами и глубокими персонажами, что делает его увлекательным и захватывающим для зрителей.