В данном произведении главный герой, Шого Яхаги, оказывается в сложной ситуации, когда его обвиняют в убийстве, и он вынужден скрываться. В условиях постоянной угрозы он стремится установить связь с искусственным интеллектом по имени ЕВА, чтобы выяснить судьбу всех пассажиров на борту Мегазоны 23. Эта космическая станция сталкивается с нападением инопланетной расы Дезалг, что добавляет напряжения и динамики в сюжет. Шого должен не только разобраться в своей невиновности, но и найти способ защитить людей, оказавшихся в опасности. В процессе он сталкивается с множеством препятствий и раскрывает тайны, которые могут изменить судьбу всех на борту.